Archäologische Museum von Agios Nikolaos liegt im Norden des Sees Voulismeni die Straße Paleologos, 74, nur wenige Minuten zu Fuß vom Stadtzentrum entfernt. Das Museum wurde 1970 gegründet und verfügt über eine reiche Sammlung von archäologischen Funden der Präfektur Lasithi.

Die Museumsexposition ist in acht Messehallen platziert und umfasst ein riesiges Periode der Geschichte vom Neolithikum bis zur Römerzeit. Die Sammlung des Museums umfasst Keramik, Steinskulpturen, Statuen, Hausrat, eine Vielzahl von Grab Artefakte, Goldschmuck, Bronze und Elfenbein Artefakte an einer seltenen Kindergrab und mehr.

Das eindrucksvollste Exponat des Museums ist der Schädel eines jungen Mannes, in der römischen Friedhof in Potamos in der Nähe der Stadt gefunden. Der Schädel stammt aus dem 1. Jahrhundert n.Chr und mit einem goldenen Diadem in Form von Olivenblatt gekrönt. Im Mund des Schädels war eine Silbermünze aus Polirinia (Kreta), von dessen Freigabe aus der Regierungszeit des römischen Kaisers Tiberius datiert. Geldmünze, nach alter Tradition hatte der Träger, um Charon Seelen in die Unterwelt Hades über den Fluss Styx zu zahlen.

Von besonderem Interesse sind die Artefakte bei Ausgrabungen der minoischen Friedhof von Agia Fotia entdeckt. Dies ist eine prähistorische Friedhof, der 260 Minoan Gräbern gefunden wurde, ist der Ort der größten archäologischen Stätten auf Kreta. Hier im Jahr 1600 verschiedene Gefäße ohne die Verwendung einer Töpferscheibe hergestellt gegründet und sein Stil ist ähnlich wie die Kykladen-Kunst.

Präsentiert im Museum und Artefakte aus der minoischen Siedlung von Myrtos, unter denen die wichtigste gilt als die "Göttin des Myrtos" - ein Gefäß in Form einer weiblichen Figur. Das Museum zeigt auch Artefakte aus dem minoischen Palast von Malia, darunter eine prächtige Stein Schiff sinkt in Form von Triton.

Archäologische Museum von Agios Nikolaos ist eines der wichtigsten Museen der Insel Kreta.