Der Bau des neuen Gebäudes des Klosters Santa Clara in Coimbra wurde 1649 ins Leben gerufen. Alte Kloster, am Ende des XIII Jahrhundert erbaut, wurde zerstört, und es wurde beschlossen, ein neues Gebäude für die Nonnen des Ordens von Santa Clara zu bauen.

Das Projekt hat einen Benediktinermönch des Klosters und der königlichen Architekten João Turriano verantwortlich für den Bau des königlichen Architekten Mateus do Couto entwickelt. Neubau dauerte lange genug. Im Jahre 1677 ein neues Gebäude des Klosters, das als das Kloster von Santa Clara-a-Nova bekannt wurde, fuhren Nonnen. Im Jahre 1696 wurde die Kirche geweiht.

Das Hauptportal der Klosterkirche mit dem königlichen Wappen, die von zwei Engeln getragen wird eingerichtet. Das Innere der Kirche ist im Barockstil. Die Kirche hat ein Langhaus, Querhaus fehlt. Altarbilder in geschnitzten und vergoldeten Holzrahmen - die Seitenkapellen und die Hauptkapelle ist mit 14 Altarbilder aus dem XVII Jahrhundert im Stil der "Talya dorado" eingerichtet. Darüber hinaus wurde ein neues Kloster Grab mit den Überresten der Königin Isabella von Portugal, dem Gründer des Klosters bewegt. Nach dem Tod ihres Mannes, König Dinis, war die Königin in Coimbra Kloster Santa Clara bis zu seinem Tod und wurde dort begraben. Daher ist unter den Einheimischen dieses Kloster heißt das Kloster der Königin Isabella. Das Grab mit Asche, Silber und Kristall, in der Nähe der Hauptaltar der Kirche. Vor der Kirche steht ein Denkmal für Königin Isabella, vom Bildhauer Antonio Teixeira Lopes im XIX Jahrhundert.

In 1733 in der Klosterkreuzgang wurden im Stil der Renaissance erbaut. Der Aufbau dieser Galerien, die für die ungarischen Architekten Carlos Mardel.