Es war in 1590-1592 Jahre älteren Judenstadt Mordechai Mayzlom, der die umfangreiche Restrukturierung des Ghettos im Stil Renässans finanziert gebaut. Die Synagoge wurde unter der Leitung von Joseph und Juda Welle Goldshmida de Herz gebaut. Ursprünglich wurde das Gebäude schwer bei einem Brand im Jahre 1689, nach der das Gebäude wurde im Barockstil renoviert beschädigt. Nach einer Umstrukturierung im neugotischen Stil nach A.Grotta in 1893-1905, wurde die Synagoge viel von den Merkmalen des Barock verloren. Von der ersten Disposition erhaltenen Renaissance dreischiffige Grundriss des Hauptschiffes und erhöhte weibliche Galerie.

Derzeit dient Maisel-Synagoge als Ausstellungsraum und Lager Jüdische Museum. Der erste Teil der Ausstellung Geschichte der Juden in Böhmen und Mähren von der Siedlung vor Emanzipation veranschaulicht den Verlauf der Geschichte der Juden in Böhmen aus dem zehnten Jahrhundert bis zum Ende des XVIII Jahrhundert. Der Prolog führt das historische Informationen über die Herkunft der jüdischen Siedlung in Böhmen und Mähren. Sowie die rechtlichen und sozialen Stellung der Juden im mittelalterlichen Staates. Besonderes Augenmerk wird auf die Renaissance bezahlt, sowohl im Zusammenhang mit dem Bau von Synagogen, also dem Namen ihres Gründers Mordyhaya Mayzla. Traditionelle jüdische Erziehung sind das Werk von herausragenden Wissenschaftlern, die an die Stelle der Rabbiner und Talmudschulen der Rektoren der tschechischen und mährischen jüdischen Gemeinden (Lib Rabbi David Oppenheim) besetzt.