Zoo und das Museum der Natur in Split wurden in die Stadt aufgrund der Anfang des XX Jahrhunderts, mehrere wertvolle Natur Sammlungen gespendet. Professor Umberto Dzhirometta 1923 warf die Frage der Schaffung des Museums für Naturgeschichte. Die Stadtverwaltung von Split nahm die Sache in die Bewertung und im Jahre 1924 gründete die erste Museum und Dzhirometta wurde ihr Führer bis zu seinem Tod im Jahr 1939.

In den ersten Jahren seines Bestehens wurde das Museum in einem der städtischen Gebäude in der Innenstadt. Bald wird der Raum war nicht genug, und das Museum wurde zu einem der Gebäude des Parks Marjan bewegt. Zusammen mit dem Museum eröffnet einen kleinen Zoo, was einige Arten von einheimischen und exotischen Tieren. Zum ersten im ehemaligen Jugoslawien Aquarium neben dem Gebäude des Museums wurde zusätzlicher Platz gebaut. Einige Jahre später war das Oceanarium geschlossen und in einen kleinen Käfig umgewandelt. Heute in Split Zoo hat über 300 Arten von Tieren.

Das Gebäude im Park Marjan an den Feindseligkeiten im Jahr 1991 wurde aus Sicherheitsgründen geschlossen. Dann zog das Museum in die Festung Gripe, und nach 1997 ist er an Marian zurück. Nach dem Jahr 2000, auf Wunsch der Mitarbeiter auf die Bedürfnisse des Museums hat sich einen neuen Raum zugeordnet, mit einer Gesamtfläche von etwa 1.156 Quadratmetern, in dem das Museum begann ihre Arbeit im Januar 2002.

Vor der Eröffnung des neuen Direktor des Museums Museumssammlungen wurde neu organisiert und erzählte einige neue Aufnahmen (zB Sammlung von ausgestopften Tieren und Vögeln, der Abteilung für Geologie und Paläontologie, Entomologie, Institut für Wirbeltiere und wirbellose Tiere, etc.). Wurden auch Arbeiten an der Verarbeitung und Systematisierung der Exponate, die Feldarbeit in den zentralen Teil von Dalmatien durchgeführt, zahlreiche Ausstellungen im Museum und außerhalb. Darüber hinaus beteiligt die Mitarbeiter des Museums in zahlreichen wissenschaftlichen Konferenzen.

Im Erdgeschoss des Museums beherbergt eine Vielzahl von Ausstellungen, und auf den anderen Etagen beherbergen die Dauerausstellung. Jeder kann die Museums zusätzlichen Materialien über die Geschichte des Museums und lokale Naturgeschichte zu kaufen.